プリント基板は階層構造になっておりプリント基板設計CADも実際の基板と同様、シルク、レジスト、部品面パターン、半田面パターンが透過視されて描かれています。それらの個別の階層を層（レイヤー）と呼んでいます。CADごとに独自の名称を設けているものもあります。CADVANCEの場合はレベルと呼んでいます。その他にも呼び方は多数あると考えられます。下に層選択（レイヤー）CAD画面の一例を挙げておきます。プリント基板設計CAD（CR8000 DESIGN FORCE)から出図されたPDFデータにマルチレイヤー設定が可能になりかなり見やすくなっています。今後はこのような形式が一般的になると考えられます。